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根据《中华人民共和国个人所得税法》及有关规定，灵活用工人员从平台获取的收入可能包括劳务报酬所得和经营所得两大类。灵活用工人员在平台上从事设计、咨询、讲学、录音、录像、演出、表演、广告等劳务取得的收入，属于“劳务报酬所得”应税项目，由支付劳务报酬的单位或个人预扣预缴个人所得税，年度终了时并入综合所得，按年计税、多退少补。灵活用工人员注册成立个体工商户、或者虽未注册但在平台从事生产、经营性质活动的，其取得的收入属于“经营所得”应税项目，“经营所得”以每一纳税年度的收入总额减除成本费用以及损失后的余额为应纳税所得额，适用经营所得税率表，按年计税。
因此，灵活用工人员取得的收入是否作为经营所得计税，要根据纳税人在平台提供劳务或从事经营的经济实质进行判定，而不是简单地看个人劳动所依托的展示平台，否则容易导致从事相同性质劳动的个人企业纳税压力不同，不符合税收公平原则。比如，从事教育培训工作的兼职教师，在线下教室里给学生上课取得收入按劳务报酬所得缴税，在线上平台的直播间给学生上课取得收入按经营所得缴税，同一性质劳动，不宜区别对待。
根据《财政部、国家税务总局关于合伙企业合伙人所得税问题的通知》规定，合伙企业施行“先分后税”原则，对合伙企业本身不征税，只对投资人征税。投资人是自然人的，缴纳个人所得税；投资人是法人和其他组织的，缴纳企业所得税。 有限合伙企业作为合伙企业的一种特殊形态，同样适用上述规定。因此，对于自然人投资者，应比照“个体工商户的生产经营所得”，适用5％～35％的五级超额累进税率，计算征收个人所得税；而对于法人和其它组织，根据《企业所得税法》的规定，适用25％的企业所得税率。
个人所得税的纳税方式主要有纳税人自行申报纳税和企事业单位代扣代缴两种，而且，除了少数情况下，由纳税人按规定自行申报缴纳之外，大多是由企事业单位按照法律的规定实行代扣代缴。当个人所得税由纳税人自行申报缴纳时，企事业单位不存在个人所得税扣税与税款缴纳问题，自然不需要进行会计核算；但是，如果按企事业单位按照法律的规定对纳税人的个人所得税税款实行代扣代缴的，那么，就必须在账簿上反映个人所得税税款扣缴情况。这种核算既是财务会计制度的要求，也是税收法律法规的要求。
企事业单位要进行代扣代缴个人所得税税款的核算，必须设置“应交税金——应交个人所得税”会计科目。此科目为负债类科目，当企事业单位在向个人支付所得代扣个人所得税税金时，记入此科目的贷方；实际将代扣的税款向税务机关申报并缴纳入库时，则记入其借方。该科目的期末余额一般在贷方，表示期末累计已代扣尚未申报解缴的个人所得税额。其他涉及的会计科目要视扣款的来源确定。如，扣缴工资、薪金所得税时，一般通过“应付工资”科目进行；扣缴承包人、承租人应缴纳的个人所得税时，一般通过“应付利润”科目进行；扣缴债权人利息所得的所得税时，一般通过“应付债券——应计利息”科目进行。
二、代扣代缴个人所得税的具体会计核算（一）工资薪金所得的个人所得税扣缴的会计核算
企事业单位为职工代扣代缴个人所得税有两种情况：第一，职工自己承担个人所得税，企事业单位只负有扣缴义务；第二，企事业单位既承担税款，又负有扣缴义务。但是不管哪一种，在个人所得税的会计处理都是相同的，即在向职工支付工资薪金并按规定扣缴职工应缴纳的个人所得税时，作如下会计分录：
贷：应交税金——应交个人所得税
实际申报缴纳个人所得税时则作会计分录：
借：应交税金——应交个人所得税
在此，我们也必须清楚，即目前很多的学者都认为单位为个人负担的个人所得税税款是不能在企业所得税税前列支的，包括国家税务总局下发的许多文件也都强调这一点。其实这种观点是不合理的。在任何时候，单位为个人负担个人所得税税款都属于单位工资薪金成本的加大，如果企业采用计税工资制度，那么也就意味着计税工资总额的增大。对于企业计提并计入成本与费用的计税工资总额，只要未超过计税工资税前扣除标准，那么就应当允许纳税人将其计入成本费用并实现税前扣除。
（二）承包、承租经营所得的个人所得税扣缴的会计核算
个人对企事业单位承包承租经营的可能会涉及到三个应纳税项目：工资薪金所得、对企事业单位承包承租经营所得以及个体业户生产经营所得。但是由于个体工商业户的个人所得税由个人自己申报缴纳，因而，承包、承租经营所得涉及到个人所得税扣缴的核算则只有两种情况：
（1）承包者个人每月从企业领取工资的，企业须按月扣缴工资薪金所得的个人所得税，有关的会计核算同工薪所得的扣缴个人所得税会计核算相同。